世界上有507种虫草，其中我国境内有108种，只有一种叫冬虫夏草。特别是亚香棒虫草性状与冬虫夏草十分相似，仅从性状上区分很难。因此，要对冬虫夏草的伪劣、杂质检查以及重金属残留给予高度重视。
从人们的感官鉴别冬虫夏草的真伪，首先伪劣冬虫夏草区别于其气极弱，虫体暗黄棕色，横切面“V”字横纹有或者不甚明显，水洗或者煎煮即褪色，或为淡黄白色，尝之味苦。掺杂冬虫夏草为在冬虫夏草的折断处用铅丝或者竹签插入接上。更为恶劣的是在冬虫夏草的表面滚上铁粉，这样不但可增重，而且给鉴定增加了难度。经验方法是看冬虫夏草的折断面，如有铅丝或竹签，尝之有沙石感，可在X光下观察呈漆黑一片，说明为参杂品。
研究者采用红外光皮技术对野生冬虫夏草进行研究，结果发现真品冬虫夏草在1746，1655和1549，1152，1082和1022cm-1处有特征吸收峰，而伪虫草在1746，1656和1544，1158，1082和1025cm-1处有特征吸收峰，说明伪品冬虫夏草含有脂类、蛋白质和多糖等物质，但峰强度很弱。同时，主要的是伪品冬虫夏草在1711cm-1处有羧酸强吸收峰，而真品冬虫夏草则无此峰。
采用近红外光谱分析冬虫夏草发现，药材粉末和甲醇提取液近红外光谱可以较好地区分青海与西藏两产地的样品，而甲醇提取后的药渣近红外光谱区别则不如提取液明显。
用蛋白电池将冬虫夏草正品与其混淆品基本可分辨清楚。冬虫夏草与5种伪品因来源于不同科属，所含蛋白质不同，故其电池谱带的条数、位置、深浅度明显不同，可作为鉴别真伪的依据。古今采用高效毛细管电泳（HPCE）法对冬虫夏草、亚香棒虫草、地蚕进行鉴别，效果较好。
以紫外吸收光谱鉴别冬虫夏草与亚香棒虫草，于200~400nm波长范围内测定吸收图谱，结果冬虫夏草在270，281，295，304nm处有4个长吸收峰，而亚香棒虫草在272，291nm处有2个大吸收峰。
